Θέματα Μοριακής Αναγνώρισης – Φεβρουάριος 2023
Θεωρία
1. Ερωτήσεις πολλαπλής επιλογής (τα περισσότερα είχαν παραπάνω από μία σωστές απαντήσεις)
o Μοτίβα
o Μοριακούς ακόλουθους
o Αλληλουχίες σήματος
o Πρωτεϊνική μετατόπιση
o λ – καταστολέας
o Δακτύλιος ψευδαργύρου
o Αλληλεπίδραση ΤΒΡ – DNA (είναι εκεί με τους TFII & TFI)
o Μεταγωγή σήματος
o GPCRs
o Ποιες είναι οι δομικές ενότητες των αντισωμάτων
o Ποια είναι η δράση της πενικιλίνης
2. Συμπλήρωση κενών με τις Ga πρωτεΐνες
3. Πινακάκι με τις αλληλουχίες σήματος (ποια αλληλουχία αμινοξέων σχετίζεται με μετατόπιση σε κάποιο οργανίδιο του κυττάρου, π.χ. πυρήνας, μιτοχόνδριο κλπ.)
4. Συμπλήρωση κενών με τα αντισώματα τύπου IgG
5. Ερωτήσεις σύντομης ανάπτυξης ή έλεγε μία σωστή πρόταση και εμείς έπρεπε να πούμε γιατί είναι σωστή.
o Η σωστή λειτουργία της πρωτεΐνης εξαρτάται από τη σωστή δομή της
o Το συνολικό φορτίο μιας πρωτεΐνης εξαρτάται από το pH
o Πώς σημαίνεται μια αλληλουχία ότι πρέπει να γίνει η μετάφραση στο ΕΔ και γιατί υπάρχουν δύο σημεία ελέγχου
o Δεν χρειάζονται όλες οι πρωτεΐνες για να είναι λειτουργικές να έχουν τεταρτοταγή δομή
o Δύο παράγοντες που μια πρωτεΐνη μπορεί να βρεθεί σε τοπικό ενεργειακό ελάχιστο όταν είναι σε τραχύ ενεργειακό πεδίο
o Τι είναι μη ειδικές αλληλεπιδράσεις και να δώσουμε ένα παράδειγμα
o Πού γίνεται η πρωτεϊνοσύνθεση και να δώσουμε 5 πιθανούς προορισμούς της πρωτεΐνης
6. Δύο ασκήσεις με εικόνες: με το είδος των αλληλεπιδράσεων και να προτείνουμε ένα ολιγοπεπτίδιο (ήταν ακριβώς ίδιες με αυτές στις ερωτήσεις εμπέδωσης, με τη διαφορά ότι εκεί που είχαμε να προτείνουμε ένα ολιγοπεπτίδιο δεν ήταν πολλαπλής επιλογής όπως στην εμπέδωσης αλλά έπρεπε να το γράψουμε εμείς από την αρχή)
Εργαστήριο
Όλες οι ερωτήσεις του εργαστηρίου ήταν από τις ερωτήσεις εμπέδωσης της εισαγωγής!
1. Να γράψουμε ένα πεπτίδιο και να βάλουμε τις γωνίες ψ και φ (1η ερώτηση από εμπέδωσης εισαγωγής)
2. Μας έδινε κάποια διπεπτίδια και έπρεπε να διαλέξουμε με ποιο ένζυμο (που έδινε το ακριανό πεπτίδιο του ενεργού κέντρου του) θα έχει μεγαλύτερη συγγένεια. Το δεύτερο υποερώτημα αυτής της άσκησης ήταν να διαλέξουμε ένζυμο με μεγαλύτερη συγγένεια με βάση την Kd (μας έδινε μία Kd ήδη)
3. Να περιγράψουμε τον δεσμό υδρογόνου μεταξύ του αμιδικού υδρογόνου και του καρβοξυτελικού οξυγόνου.
4. Να γράψουμε το αμινοξύ της προλίνης και γιατί η προλίνη προκαλεί κάμψη στο DNA
5. Είχε την ερώτηση για το τι είναι το pKa στις πρωτεΐνες και στα αμινοξέα (κάπως έτσι την είχε επίσης στις εμπέδωσης)
ΣΗΜΕΙΩΣΗ!: τόσο για θεωρία όσο και εργαστήριο αρκεί να διαβάσετε τις ερωτήσεις εμπέδωσης τα θέματα ήταν πολύ κομπλέ, διαβαθμισμένης δυσκολίας και κάλυπταν όλη την ύλη.