Βιοχημεία Θεωρία

2016 Tσακαλιδου

Τα ένζυμα που συμμετέχουν στις αλυσίδες μεταφοράς ηλεκτρονίων και τα βοηθητικά μόρια

8 ενζυμα (7 στη μητρα του μιτοχονδριου και 1 εχει προσβαση σ αυτην) Αυτά είναι : συνθαση του κιτρικου, ακονιταση, αφυδρογοναση ισοκιτρικου, αφυδρογοναση 2-κετογλουταρικου, συνθεταση ηλεκτρυλο-CoA , αφυδρογοναση ηλεκτρικου, φουμαραση, αφυδρογοναση μηλικου (στο ΚΚΟ παραγονται 12 μορια ΑΤΡ)

τι προκαλεί ο Συναγωνιστικός και μη συναγωνιστικός παράγοντας απ: συναγωνιστικη αναστολη-> εξειδικευμενη προσδεση αναστολεων στο ενεργο κεντρο των ενζυμων που συναγωνιζεται τη δεσμευση του υποστρωματος και αιρεται με αυξηση της συγκεντρωσης του υποστρωματος

Μη συναγωνιστικη αναστολη-> ο μη συναγωνιστικος παραγοντας συνδεεται στο ενζυμο η στο συμπλοκο ενζυμου υποστρωματος σε θεση διαφορετικη από το υποστρωμα και το συμπλοκο το τελευταιο που δημιουργειται δεν οδηγει στο σχηματισμο προιοντος. Η αναστολη δεν αιρεται με αυξηση της συγκεντρωσης του υποστρωματος

Αμινοξέα με πλευρική αλυσίδα που περιέχουν θείο και υδροξύλιο τα 2 μονοπάτια πεντοζών πέρα από παραγωγή ενέργειας (?)

τι είναι τα αμφιπαθή αμινοξέα απ: η αμφίφιλα μορια δηλαδη περιεχουν μια υδροφιλη και μια υδροφοβη ομαδα

που γινονται οι διαδικασίες (τμήμα κυττάρου π.χ. ριβοσώματα, κυτταρόπλασμα)

α) Β οξείδωση λιπαρών οξέων( μιτοχονδρια)

β) γλυκονεογένεση (κυτταροπλασμα)

γ)κύκλος κρέμπς (μιτοχονδρια)

δ) σύνθεση λιπιδίων( πλαστιδια= χλωροπλαστες η λευκοπλαστες)

ε) μεταφορά ηλεκτρονίων (κυτταρικη μεμβρανη, συμπικινονη)

3 χαρακτηριστικά του πεπτιδικού δεσμού απ:

1)κάθε νεος πεπτιδικος δεσμος σχηματιζεται μονο μεταξυ της καρβοξυλομαδας της αυξανομενης πολυπεπτιδικης αλυσιδας και της αμινομαδας του προστιθεμενου αμινοξεος. 2) για κάθε σχηματισμος πεπτιδικου δεσμου απομακρυνεται ταυτοχρονα ένα μοριο νερου

3) η αντιδραση πεπτιδικου δεσμου αποτελει τυπικο παραδειγμα μιας αντιδρασης συμπυκνωσης

ποια αντίδραση καταλύει η καρβοξυλάση του πυροσταφυλικού και πως το συνένζυμο ακέτυλο Α την επηρεάζει απ: Η καρβοξυλαση του πυροσταφυλικου εντοπιζει την αναγκη για περισσοτερους μεταβολιτες του ΚΚΟ μεσω του θετικου τροποποιητη ακετυλοCoA. Οποιαδηποτε ελαττωση του ρυθμου του κυκλου λογω μειωμενης C οξαλοξικου η αλλου μεταβολιτη εχει ως αποτελεσμα τη συσσωρευση του ακετυλοCoA. Η αυξηση της C του ακετυλοCoA ενεργοποιει την καρβοξυλαση του πυροσταφυλικου η οποια αναπληρωνει την ελλειψη του οξαλοξικου και επομενως ο ΚΚΟ επαναλειτουργει

ποιος είναι ο ρόλος της καρνιτίνης απ: μεταφερει την ακυλομαδα του ακυλοCoA από την εξωτερικη μεμβρανη του μιτοχονδριου στην εσωτερικη μεμβρανη και τελικα στη μητρα του μιτοχονδριου. Αποτελειται από τη μετατοπαση της καρνιτινης ακυλοκαρνιτινης και 2 μεταφορασες της ακυλοκαρνιτινης (εσωτερικη CPT I και εξωτερικη CPT II)

το ενζυμο επηρεάζει την ταχύτητα ή τη θερμοδυναμική ενέργεια της αντίδρασης απ: επιταχυνει τη ταχυτητα της αντιδρασης αλλαζοντας την ενεργεια ενεργοποιησης της αντιδρασης (συνηθως την μειωνουν)

Σεπτέμβριος 2017 ( Ιούνιος 2016, Σεπτέμβριος 2016)

1) Να χαρακτηριστούν ως ενδοκυτταρικές ή εξωκυτταρικές οι πεπτιδάσες και οι βακτηριοσίνες.

2) Τι σημαίνουν τα αρχικά H.P.L.C. ?

3) Περιγραφη H.P.L.C.

4) Περιγραφή WDA

5) Τι είναι η λυσοζύμη, με τι προστίθεται και τι κάνει στο δείγμα; (κατα την προετοιμασία)

6) Στην 1η άσκηση τι φωτομετρούμε; ( τι περιέχει το δείγμα και τι το τυφλό;)

7) Πως κάνουμε ποσοτικό προσδιορισμό των πρωτεΐνών; ( τι βρίσκουμε)

8) Τι δείγματα χρησιμοποιούμε στην 2η άσκηση; 

9) Ποιός ο διαλύτης στην άσκηση με την H.P.L.C. ;

10) Ποιές βιοχημικές ιδιότητες εξετάστηκα στην 5η άσκηση;

11) Ποιά λιπολυτικά ένζυμα γνωρίζετε;

BIOXHMEIA ΘΕΩΡΙΑ - ΙΟΥΝΙΟΣ 2018

1. Ποια αμινοξέα περιέχουν υδροξυλική ομάδα και ποια σουφιδρυλική;

2. Τα ένζυμα επιρεάζουν την θερμοδυναμικότητα ή την ταχύτητα της αντίδρασης και πως;

3. Πως επιδρά ο συναγωνιστικός και ο μη συναγωνιστικός αναστολέας;

4. Σε ποιο τμήμα του κυττάρου γίνεται η γλυκόλυση, γλυκονεογένεση, ο κύκλος του κρεμπς, η αναπνευστική αλυσίδα, η β' οξείδωση των λιπαρών οξέων, η βιοσύνθεση των λιπαρών οξέων;

5. Ποιος δεσμός χαρακτηρίζει την πρωτοταγή δομή της πρωτεΐνης και ποια τα τρία βασικά χαρακτηριστικά του;

6. Ποια είναι τα τέσσερα σύμπλοκα στην αλυσίδα μεταφοράς ηλεκτρονίων και ποιες οι προσθετικές ομάδες;

7. Ποια μόρια ονομάζονται αμφιπαθή;

8. Πόση ενέργεια παράγεται κατά την πλήρη οξείδωση του λαυρικού οξέος; (C=12)

9. Εκτός από την παραγωγή ενέργειας, ποιοι οι βιολογικοί ρόλοι του μονοπατιού των φωσφορικών πεντοζών;

10. Ποια αντίδραση καταλύει η πυροσταφυλική αφυδρογονάση και ποια η πυροσταφυλική καρβοξυλάση; Με ποιον τρόπο το ακέτυλο-συνένζυμο α ρυθμίζει την δράση τους;